Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPLO60437 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPLO60437 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms