Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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