Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.425e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.455e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRO-224ENST00000492706 3677 ntTSL 211.82□□□□□ -0.525e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TINAGL1-206ENST00000468635 827 ntTSL 511.69□□□□□ -0.545e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TINAGL1-210ENST00000498429 904 ntTSL 311.69□□□□□ -0.545e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 LINC01226-207ENST00000640226 551 ntTSL 411.33□□□□□ -0.65e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.625e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CFB-271ENST00000425368 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.636e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CFB-273ENST00000460718 768 ntTSL 510.94□□□□□ -0.666e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 CFB-274ENST00000461483 1277 ntTSL 510.88□□□□□ -0.676e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 GLRX-207ENST00000512469 473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.715e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.722e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.742e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRO-204ENST00000375041 3488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.745e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 TRO-208ENST00000420798 3613 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.775e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZNF69-201ENST00000340180 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.796e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.822e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.92e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZNF69-203ENST00000445911 569 ntTSL 29.28□□□□□ -0.926e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.932e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.952e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 SPIN2B-201ENST00000275988 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -15e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -12e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.012e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.042e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.056e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.062e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.082e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.12e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.122e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.152e-11■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 GLRX-201ENST00000237858 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.155e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 GLRX-202ENST00000379979 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.165e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZNF207-211ENST00000579810 979 ntTSL 57.81□□□□□ -1.165e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.216e-9■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.365e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 ZNF207-213ENST00000581531 3560 ntTSL 55.98□□□□□ -1.455e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.555e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MLLT10-210ENST00000468309 647 ntTSL 35.24□□□□□ -1.575e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTUS1-217ENST00000520196 5205 ntTSL 1 (best)5.16□□□□□ -1.585e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.655e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.725e-7■□□□□ 9.2
PRPF4O43172 AFF1-207ENST00000511442 463 ntTSL 32.47□□□□□ -2.015e-7■□□□□ 9.2
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PRPF4O43172 MAN2C1-209ENST00000563013 849 ntTSL 514.14□□□□□ -0.152e-6■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 MAN2C1-231ENST00000566253 549 ntTSL 411.56□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.525e-10■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.315e-10■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.11■□□□□ 0.655e-10■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.385e-10■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 SLC35C2-211ENST00000487729 803 ntTSL 515.46■□□□□ 0.076e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 SLC35C2-205ENST00000420518 588 ntTSL 315.09■□□□□ 0.016e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.066e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 SLC35C2-206ENST00000424568 731 ntTSL 212.61□□□□□ -0.396e-8■□□□□ 9.1
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PRPF4O43172 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 36.07□□□□□ -1.445e-6■□□□□ 9.1
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PRPF4O43172 PLXNB1-208ENST00000465117 627 ntTSL 313.41□□□□□ -0.265e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 INTS11-242ENST00000531377 816 ntTSL 516.54■□□□□ 0.241e-11■□□□□ 9.1
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PRPF4O43172 ZNF782-206ENST00000485322 305 ntTSL 324.64■■□□□ 1.542e-8■□□□□ 9.1
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PRPF4O43172 ADAM10-212ENST00000558004 587 ntTSL 516.71■□□□□ 0.277e-16■□□□□ 9.1
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PRPF4O43172 BAX-209ENST00000506183 383 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.222e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.222e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 BAX-208ENST00000503726 488 ntTSL 215.29■□□□□ 0.042e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 BAX-204ENST00000356483 677 ntTSL 1 (best)15.25■□□□□ 0.032e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 BAX-212ENST00000515540 300 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-8■□□□□ 9.1
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PRPF4O43172 ADAM10-215ENST00000560608 587 ntTSL 413.29□□□□□ -0.287e-16■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ADAM10-204ENST00000439637 601 ntTSL 313.15□□□□□ -0.37e-16■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ZNF782-203ENST00000466833 628 ntTSL 311.44□□□□□ -0.582e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.747e-16■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ZNF782-207ENST00000498811 698 ntTSL 310.2□□□□□ -0.782e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ZNF782-201ENST00000289032 2355 ntTSL 26.06□□□□□ -1.442e-8■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 VIL1-205ENST00000454069 532 ntTSL 39.82□□□□□ -0.843e-7■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.432e-9■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-9■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.332e-9■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-9■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 UBA52-207ENST00000596273 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-9■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 UBA52-201ENST00000430157 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-9■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 UBA52-205ENST00000595683 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-9■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ATXN2L-221ENST00000566946 2162 ntTSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.921e-32■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ATXN2L-208ENST00000562583 1933 ntTSL 1 (best)17.58■□□□□ 0.41e-32■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ATXN2L-213ENST00000564162 770 ntTSL 516.67■□□□□ 0.261e-32■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ATXN2L-219ENST00000566007 471 ntTSL 38.7□□□□□ -1.021e-32■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 ACAA1-207ENST00000440176 1328 ntTSL 219.95■□□□□ 0.785e-7■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.264e-6■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 SPON2-218ENST00000512888 851 ntTSL 222.42■■□□□ 1.184e-6■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.934e-6■□□□□ 9.1
PRPF4O43172 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.644e-6■□□□□ 9.1
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