Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLGNO14967 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms