Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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