Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms