Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms