Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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