Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms