Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms