Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF25A6NGN4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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