Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6L4A6NEF3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms