Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GMNCA6NCL1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms