Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms