Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms