Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PARP3Q9Y6F1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms