Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAF6Q9Y4K3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms