Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms