Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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