Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms