Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms