Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms