Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms