Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMURF2Q9HAU4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms