Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C11orf49Q9H6J7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms