Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms