Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms