Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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