Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5RAP3Q96JB5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms