Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms