Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms