Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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