Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms