Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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