Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC84Q86UT8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms