Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA2D4Q7Z3S7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms