Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE4Q6UWF7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms