Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.586e-7■■■■■ 27.2
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PRPF8Q6P2Q9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 27.2
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PRPF8Q6P2Q9 CAMKK1-203ENST00000381769 3508 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.054e-8■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 TOGARAM1-202ENST00000361577 6247 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 27.2
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PRPF8Q6P2Q9 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.095e-6■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 C12orf73-208ENST00000549960 620 ntTSL 38.11□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 NCAPH-207ENST00000477409 1573 ntTSL 1 (best)8.09□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 27.2
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PRPF8Q6P2Q9 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.249e-9■■■■■ 27.2
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PRPF8Q6P2Q9 WDYHV1-209ENST00000524254 764 ntTSL 37.18□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 TTLL4-213ENST00000461181 590 ntTSL 46.8□□□□□ -1.323e-10■■■■■ 27.2
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PRPF8Q6P2Q9 FOXM1-205ENST00000535350 618 ntTSL 36.69□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 NUP214-218ENST00000528114 575 ntTSL 46.41□□□□□ -1.381e-8■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.49e-9■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.411e-8■■■■■ 27.2
PRPF8Q6P2Q9 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.425e-7■■■■■ 27.2
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