Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL2Q6F5E8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms