Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPANXN3Q5MJ09 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms