Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms