Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC153Q494R4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms