Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms