Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL40Q2TBA0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms