Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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