Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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