Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms