Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A5Q15758 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms