Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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