Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms